南科管理局證實，台積電在嘉義科學園區興建的第一座CoWoS廠，6月初挖掘到疑似遺跡，目前暫停施工，並提出因應策略，先行興建第二座CoWoS廠，南科管理局會全力協助；目前施工的第一座CoWoS廠，台積電依法提出維護計畫及監看計畫給權責單位嘉義縣政府。
嘉義科學園區先前進行規劃整地時，曾發現疑似遺址，去年底提出開發行為申請變更，調整公園用地位置，減少影響，已獲環評通過；嘉義縣文化觀光局表示，針對嘉義科學園區的疑似遺址，已召開文資審議會，決議無論敏感區或非敏感區，開發單位進行相關開發工程時，應每日全程施工監看。
嘉義縣文化觀光局表示，嘉義科學園區內台積電施工工程通報發現疑似遺跡，現場已停工，文觀局並已依文資程序辦理中。
熟悉園區、廠區開發工程人士指出，各產業、科學園區在開發過程中挖掘到遺址並不罕見，如南科園區開發過程中就有多處考古遺址，後來還成立國立臺灣史前文化博物館南科考古館，對於建廠及開發時程，若面積小則影響輕微，若面積範圍大，可能就會影響建廠開發進度。
