據了解，警10月20日下午4時30分接獲通報後，隨即趕赴現場處理，但因該流域溪畔有不少爛泥，造成打撈困難，警消花了約1小時才將浮屍打撈上岸。初步調查，該具遺體上並未發現任何證件，也無明顯外傷。
另一方面，高雄保五總隊一名吳姓小隊長於國慶日當天凌晨3時離家出走，並將皮包、手機、鎖匙等物放在家中，吳小隊長離家後毫無音訊，警方為確認鹽水溪畔發現的這具浮屍是否為吳姓小隊長，通知保五總隊幹部、家屬到場認屍，但因屍體明顯浮腫變形難以辨認，即擇期相驗。
檢方21日上午10時50分率法醫進行相驗，由於死者屍體嚴重腐敗、浮腫，吳男胞弟依舊無法確認其身分，加上也無法收集指紋，檢察官指示，採檢體進行DNA比對，進一步確認身分，而暫以無名屍名義查處。
台南市警二分局30日下午收到DNA比對報告，證實該名死者DNA比對確認係吳小隊長，檢警將發還遺體給吳小隊長家屬辦理後事。
