陳時中接受記者訪問時表示，當時我國政府的立場是要將短期滯留、生活上不方便的台灣人趕快從已經封城的武漢市趕快接回台灣，但當時中國資訊封閉，第一班武漢包機很多旅客根本不符合「緊急需要幫助的人」的條件。
陳時中說，後來積極溝通下，才會有第二批、第三批武漢包機，讓很多真正需要幫助的老弱婦孺能回台灣，「反而是我們不希望造成中國困擾，滯留在中國也對台灣人不是好事」。至於馬英九「造成中國困擾」的說法，陳時中批評，馬總統自己是都沒有做事情，所以有點心虛，要不然這些話都和事實不相符。
馬英九在參訪途中還稱，中國在防疫初期對整個人類的貢獻，讓病毒沒有往外擴散；陳時中說，現在仍指向病毒是從武漢實驗室造成這場人類的災難，且中國也不配合整體調查，因此還有很多相對不清楚的情形，「但若說是中國對人類的貢獻就有點講反話了」。
