太陽能板可設置於陸域與水域，北門蘆竹溝社區緊鄰魚塭地，案場被評估為「地層嚴重下陷的不利工作區」，每公頃土地允許裝設的光電板面積也從4成提高為7成，社區遭大面積的水域光電板包圍，光電板在陽光直射下亮晃晃，是光電業者及綠電蟑螂眼中的生財工具，對世居當地的居民而言，已嚴重影響生活品質。
住在魚塭邊的居民表示，魚塭變光電田後的最大感受，就是夏天變得更熱，「溫度高很多」。蘆竹溝反對設置太陽能自救會表示，大量光電案場位在社區南邊，收集光熱的光電板上方充滿熱空氣，夏天南風吹拂熱氣全吹進村裡。
居民曾在夏季測到43.7度高溫，但當天氣象局公布的蘆竹溝社區溫度卻只有36度，居民痛斥光電板帶來的熱島效應是最難忍受的災難。社區盛行養蚵產業，居民每到夏季就得忍受在酷熱環境中生活與工作，政府卻毫無配套對策。
黃姓居民表示，居民不反對政府發展光電，但應以屋頂光電為優先。平地種電已發現問題重重，包括魚塭種電後如何養魚、捕魚？光電板的清洗劑流入魚塭，「這魚你敢吃嗎？」，痛批政府「想做就做，不顧在地居民感受」。
除了熱島效應，台南市北門、七股區溼地原是候鳥最愛的棲息地，但近年候鳥轉棲他處。經營民宿與生態導覽的洪有志觀察候鳥已有20年，他發現以往固定會在北門區棲息1個多月的黑腹燕鷗，近年出現的數量不穩定，最大因素是台南沿海廣設光電場，造成生態棲地面積減少，候鳥無處覓食。
洪有志表示，今年嘉義縣布袋鎮候鳥數量大爆發，台南候鳥卻時有時無，與沿海種電有很大關聯。他痛心政府發展能源造成搶地，原本要做黑琵觀光區的七股、北門地區，現在卻變一大片光電場，「雖然能源加分、觀光卻0分」。
針對外界質疑，台南市政府回應，根據台江國家公園管理處去年底公布的數據，台灣黑琵數量3824隻，佔全球數量62%，台南2158隻、嘉義962隻、高雄369隻、雲林227隻、屏東26隻、金門29隻、宜蘭27隻，台北、桃園、新竹、彰化、花蓮及台東等地則為個位數。稀有候鳥如藍歌鴝、董雞、諾氏鷸均現身大北門地區，可見光電發展避開敏感地帶，政府結合對地綠色環境給付，與漁民聯手保育生態，兼顧地方永續發展。
此外，經濟部也早已對外澄清，太陽光電系統不需使用化學清洗劑，其設置多採傾斜設計，所以下雨時具有自潔效果，此外，清洗模組僅需使用高壓清水注、長桿拖把等工具，就能清洗乾淨，平均一年清洗2次，不需任何化學藥劑。
台南市政府強調，根據氣象局在台南北門測站的紀錄，夏季最高溫大約在攝氏30度上下，春季與冬季的平均溫度則在20度左右。目前測站沒有出現43.7度的紀錄。大北門地區歷年來都是台南最低溫、且最容易出現漁業寒害的地區，在缺乏高樓大廈的情況下是否會出現都市熱島效應，有待更多的觀察。
